甲基托布津或多菌灵粉消毒法用50%甲基托布津或50%多菌灵粉，以1∶100比例与细土混匀，播种前后将药土撒入苗床内。此法除预防苗期病虫外，还可预防枯萎病。
五氯硝基苯消毒法用40%五氯硝基苯8克加细干土40~50公斤拌匀，播前将苗床浇透水，待水渗下后，取1/3药土撒在畦面上，把催好芽的种子播上，再把2/3药土覆盖在种子上面，使种子夹在药土中间。
敌克松消毒法用95%敌克松可湿性粉5克，加10公斤细土混匀，播前将床土浇透水，撒入苗床，也可用95%敌克松可湿性粉200~400倍液喷洒苗床。
福尔马林消毒法播前2~3周，将苗床土耙松，每平方米用40毫升药对水4公斤，浇在床土上，然后用不透明覆盖物盖4~5天，揭去覆盖物后将土耙松，待2周后药液挥发尽再播种。
代森铵消毒法将50%代森铵液配成300~400倍液，按每平方米3~5公斤浇在床土表面即可。
硫酸亚铁消毒法用3%硫酸亚铁溶液处理土壤，每平方米用药液0.5公斤；用50%的水溶代森铵350倍液，每平方米苗圃土壤浇灌3公斤稀释液，代森铵杀菌力强，能渗入植物体内，分解后还有一定的肥效。可防治黑斑病、霜霉病、白粉病、立枯病和球根类种球的多种病害。
波尔多液消毒法每平方米苗圃地用等量式（硫酸铜∶石灰∶水为1∶1∶100）波尔多液2.5公斤，加赛力散10克喷洒土壤，待土壤稍干即可播种或扦插。对斑点病、黑斑病、灰霉病、褐斑病及炭疽病效果明显。
瑞毒霉消毒法用25%的瑞毒霉50克对水50公斤，混匀后喷洒营养土1000公斤，边喷边拌和均匀，堆积1小时后摊在苗床上即可播种。